Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms