Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP3Q8WYN3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms