Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HAVCR2Q8TDQ0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HAVCR2Q8TDQ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms