Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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