Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN4CLQ8ND94 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms