Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms