Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms