Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms