Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms