Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms