Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTE2Q6XPS3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms