Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms