Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED9Q6R2W3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms