Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms