Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAAP20Q6NZ36 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms