Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRNP1Q6NT89 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms