Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms