Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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LRRC38Q5VT99 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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LRRC38Q5VT99 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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LRRC38Q5VT99 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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LRRC38Q5VT99 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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LRRC38Q5VT99 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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LRRC38Q5VT99 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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LRRC38Q5VT99 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC38Q5VT99 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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