Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDSS1Q5T2R2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms