Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms