Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms