Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms