Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms