Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWISTNBQ3B726 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms