Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM16LQ309B1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms