Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms