Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms