Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms