Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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E2F4Q16254 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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