Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDSNQ15517 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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