Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms