Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms