Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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