Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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