Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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