Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms