Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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