Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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