Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms