Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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