Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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