Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms