Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms