Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAMK2BQ13554 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms