Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRSQ13332 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRSQ13332 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRSQ13332 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRSQ13332 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRSQ13332 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRSQ13332 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PTPRSQ13332 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PTPRSQ13332 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PTPRSQ13332 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRSQ13332 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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