Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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