Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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