Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms