Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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