Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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